三重塔相傳是在1083年為了供養真如法親王所建造。 現在的三重塔是在1400年代左右重建的塔，由裝飾等可看出其年代特色。 塔內供奉著創建金剛院的真如法親王坐像。 其融入四季景緻的模樣，曾在三島由紀夫的小說「金閣寺」中登場，被讚譽為優雅的三重塔。 在1917年4月被指定為重要文物。

深沙大將是佛教的守護神，也是西遊記登場人物沙悟淨的原形。 佛像左腳內側有造像銘文，由此可知是1200年代左右的佛師快慶的早期作品。 由快慶親手書寫造像銘文的佛像，全日本約有20座。其中，舞鶴市內就有3座，2座安放於金剛院，1座安放於松尾寺。 在1910年4月被指定為重要文物。

執金剛神是守護佛法的善神。以武裝姿態，肩負保護如來佛祖的責任。 這尊佛像據說是1200年代左右的佛師快慶的作品，一般認為與深沙大將立像是成對的佛像。 因其與奈良市東大寺內的執金剛神像有許多相似之處，又有一說可能是快慶模仿東大寺的神像所造。 在1910年4月被指定為重要文物。